原标题:热科院全球首次完成并公布椰子全基因组测序
多国研究单位希望深度合作
海口网11月2日消息(记者龙易强 通讯员邬慧彧)近日,记者从中国热带农业科学院了解到,由热科院椰子研究所、热带生物技术研究所、华大基因和法国农业国际合作研究中心(CIRAD)等单位共同完成了椰子(Cocos nucifera L)的基因组测序拼接及序列分析工作,海南高种椰子全基因组测序的完成及公布尚属全球首次。
据了解,该项研究是在省科技厅国际合作专项、科技重大专项和热科院基本业务费的支持下,由热科院椰子研究所主导完成,并于10月5日在线发表在《大数据科学》(GigaScience)杂志上。该研究完成了对椰子的基因组序列拼接,生成了大小为2.20Gb的椰子基因组草图,基因组覆盖度90.91%(2.42Gb)。作为椰子的蓝图,整个基因组存在28039蛋白质编码基因,归属于14411个基因家族,其中有282个家族是椰子特有的,这些信息为椰子功能基因组的研究提供了很好的基础。目前围绕基因组序列数据基础,一个高密度的遗传图谱及更精细的椰子基因组图谱正在构建中,棕榈染色体的演化及椰子耐盐的特性的组学分析工作也将于近期完成。
椰子全基因组公布的同时也开启了椰子的后基因组时代,海南高种椰子作为一个参考基因组,将为椰子个体的重测序、功能基因的挖掘(高抗,优质相关)及抗逆分子机理(低温、高盐、干旱等)和重要品种形成机理的研究(香味、颜色等)、DNA分子标记的开发、椰子重要农艺性状的解析和关联分析、全基因组关联分析等提供参考体系,同时也为国内外椰子科技的合作提供纽带,抗寒、耐旱、耐盐、高油基因组的挖掘与利用有可能推动椰子产业取得飞跃性进展。
“这是椰子所占据全球椰子研究制高点的关键一步,是全球椰子科技里程碑性的事件,对于扩大中国在全球的科技影响意义巨大,同时将极大地促进椰子遗传育种的研究与应用。”热科院一位专家介绍道,目前该信息已经引起椰子科技界的轰动,法国、澳大利亚、斯里兰卡、印度等国家的研究单位已向热科院提出进一步深度合作的希望。
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