记者2日从中国热带农业科学院获悉,该院椰子研究所近日首次公开在《大数据科学》(《GigaScience》)杂志上发表了海南高种椰子的全基因组测序。
据了解,此前,对椰子的全基因组测序研究在行业内是一片空白。从2013年开始,中国热科院椰子研究所联合热带生物技术研究所、华大基因和法国农业国际合作研究中心(CIRAD)自筹经费展开研究,于2015年首次完成椰子的基因组序列拼接,成功发现椰子拥有282个特有基因家族,这些信息为椰子功能基因组的研究奠定了良好基础。
科学家根据全基因组测序研究,便可从基础原理解释:椰子为什么生长在海边?为什么椰子的油含量很高,并且富含水分?为什么有的椰子3年开花,有的8年开花?
该研究团队专家介绍,海南高种椰子基因组能为椰子以及棕榈科作物耐盐、抗旱、抗寒、高油等功能基因的挖掘提供参考,也可以解释椰子高油、耐盐、抗风等原理,对椰子重要农艺性状的解析及全基因组关联分析提供参考体系。“全基因组测序工作的完成,好比绘制了一张椰子基因地图,科学家可按图索骥,培育更高产、耐旱、抗病的优质新品种,育种周期将大大缩短,改变椰子新品种单一的现象。”
据悉,椰子作为重要的热带水果以及油料作物,当地许多民众直接或间接从业椰子产业,对海南地方经济和社会的发展起着非常重要作用。
研究团队专家表示,目前围绕基因组序列数据基础,一个高密度的遗传图谱及更精细的椰子基因组图谱正在构建中,棕榈染色体的演化及椰子耐盐的特性的组学分析工作也将于近期完成。
目前,来自法国、澳大利亚、斯里兰卡、印度等国的椰子研究单位已向中国热带农业科学院表达深度合作意向。(完)
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热科院全球首次完成并公布海南高种椰子全基因组测序
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